In Tom Clancy’s Rainbow 6 Patriots sieht sich Team Rainbow einer neuen und sehr realen Bedrohung namens „True Patriots“ gegenüber. Dabei handelt es sich um eine voll ausgebildete, organisierte revolutionäre Gruppe, welche die US-Regierung beschuldigt unwiderruflich von gierigen Politikern und Firmen korrumpiert worden zu sein. Die True Patriots werden alles tun, um ihr Land zurückzugewinnen. Als Rainbow muss sich der Spieler kritischen Szenarien stellen, die ihn vor schwierige moralische Entscheidungen stellen, um diese neue Art von Terroristen zu stoppen.

Neben der eindringlichen Singleplayer-Story bietet Tom Clancy’s Rainbow 6 Patriots eine große Vielfalt an neuen innovativen Co-Op- und Multiplayer-Erfahrungen. Die Spieler werden für Teamwork und das Beherrschen der neuen Spiel-Features, die Kommunikation und taktische Ausführung fordern, belohnt. Erfolg kann nur durch Entscheidungen in Sekundenschnelle und koordinierte Attacken gegen die Gegner erreicht werden.