Dr. Eggmans (AKA Dr. Robotniks) Death Egg wurde abermals von Sonic hinweggefegt und landete auf dem Gipfel eines Vulkans auf den Schwimmenden Inseln.

Dr. Eggman ist noch immer gr??enwahnsinnig und Sonic kann nicht zulassen, den Master Emerald zu stehlen und das Death Egg zu reparieren. Sonic muss sich ebenso Knuckles vom Leib halten, doch Knuckles hat auch selbst Probleme. Als Besch?tzer der Schwimmenden Inseln und aller Emeralds muss Knuckles das Seinige beitragen, um die Inseln zu sichern. Wer wird Dr. Eggman stoppen, w?hrend die beiden ihren Schlagabtausch abhalten?