
- "The Cure" - Ein Planet wurde komplett von den Borg übernommen. Der Spieler kämpft gegen Sie um den Planeten zurückzugewinnen.
- "Khitomer Accord" - Der Spieler reist in der Zeit zurück und nimmt an den Geschehnissen teil, die zu dem Kampf gegen die Borg im Tutorial von Star Trek Online geführt haben.
- "Into the Hive" - Ein verlorener Sternflotten Kapitän muss vom Spieler aufgespürt werden – zuletzt tritt der Spieler gegen die die Königin der Borg selbst an.